Действие в «Несносных пришельцах» разворачивается вокруг бурных отношений между двумя главными персонажами: Атару Моробоси , который, возможно, самый неуверенный в себе, невезучий и развратный идиот из всех, когда-либо родившихся, и упавшую на него Лам , одетую в тигровое бикини, сочетающую сексуальность, ревность и электричество. Этот сериал — хроники злоключений двух упрямых подростков в окружении по-настоящему странных персонажей. Среди таких персонажей: самый богатый мальчик на планете, школьница-сверхчеловек, огнедышащий ребёнок, жрица, обладающая суперсилой, и по совместительству школьная медсестра, милая лисица-пришелец с раздвоением личности, мастер боевых искусств с неопределённым полом, пришелец-байкер цыплёнок, ледяная королева Нептуна, ненормальный монах, гигантская кошка-призрак и сотни других сумасшедших личностей и пришельцев. И все они — в бесконечной истерии в городе под названием Томобики.

Опозоренная дворянка Шарлотта Эванс находится в бегах за преступления, которых не совершала. В лесной чаще девушка теряет сознание от изнеможения, где её и находит колдун Аллен Кроуфорд, также известный как Повелитель демонов. Аллен защищает Шарлотту от преследователей, и предлагает ей стать его горничной. Осознав, что выбор у неё невелик, Шарлотта соглашается.

Застряв в школьном холле и глядя на проливной дождь на улице, старшеклассник Кэн Усато размышлял об унылости собственной жизни, в которой ничегошеньки не происходит. Да ещё и зонт забыл. В общем, полностью погрузился в ощущение тягостности и бессмысленности своего существования. Погрузился, однако, всего на пару минут, так как его прервали президент ученического совета Судзунэ Инуками и вице-президент Рюсэн Кадзуки, которые одолжили ему зонт. Случайное знакомство грозило перерасти в дружбу и жить бы Кэну насыщенной школьной жизнью, но его новых товарищей спустя несколько минут после встречи призвали в другой мир в качестве героев! Ну и Усато засосало вместе с ними по пути. Его сэмпаи получили чудесные способности, а вот у Усато обнаружился в общем-то бесполезный в настоящем бою талант исцеления. Ничего особенного. Вот только почему все вокруг переполошились, смотрят на него испуганными глазами, наказывают помалкивать об этом и вообще норовят убрать его с глаз долой? Чем может грозить целому королевству обычный маг-целитель? Кэн узнает это на собственной шкуре, когда его заберёт с собой лидер отряда спасателей, Роза. И ничто уже Кэна не спасёт.

Второй сезон истории повествует о продолжении приключений Такаши Нацумэ (夏目貴志) — юноши, с детства имеющего способность видеть духов — и его телохранителя Мадары (斑), названного Нянко-сэнсэем. Такаши продолжает возвращать духам их имена, освобождая их от «Тетради дружбы», унаследованной от бабушки Рэйко. Он сталкивается с духами, демонами, помогает им и часто попадает в ситуации, опасные как для него, так и для окружающих.

Застенчивый старшеклассник по имени Вакана с детства грезит о том, чтобы стать мастером изготовления традиционных японских кукол. И неспроста, ведь дедушка парня добрую половину жизни отдал этому ремеслу. К сожалению, как бы Вакана ни старался, а освоить главное — создание кукольных голов — ему никак не удаётся. Зато в пошиве миниатюрной одежды он, кажется, уже весьма преуспел... и не думал не гадал, что именно это поможет ему сблизиться с одноклассницей — красавицей Марин Китагавой. Всегда весёлая, общительная и такая недосягаемая, девушка, как оказалось, имеет не менее странное, чем у Ваканы, увлечение — эроге-игры и косплей персонажей из них. Едва узнав, что парень умеет обращаться со швейной машинкой, красотка тут же вгрызается в него мёртвой хваткой и, прилагая всё своё очарование, просит сшить для неё костюм. А вот в одних ли умениях дело или, быть может, тут замешано что-то ещё, будущему мастеру-кукольнику только предстоит узнать, попутно открыв для себя простую истину: вовсе не важно, чем ты увлечён, главное — что это тебе по душе!

В цивилизованном обществе антропоморфных животных отношения между плотоядными и травоядными довольно напряжены. В Академии Черритона это взаимное недоверие достигает пика после инцидента в школьном драматическом клубе, результатом которого становится смерть альпаки Тэма. Его друг, серый волк Лэгоси, всю жизнь страдал от необоснованных подозрений, поэтому и после трагедии продолжает жить в тени, подавляя свои инстинкты, что очень раздражает оленя Луи - властного звездного актера кружка. Вскоре Луи назначает Лэгоси дежурным, и тот в первую же ночь сталкивается с крольчихой Хару, которую презирают сверстники. Волк влюбляется в неё, и чувства вынуждают его противостоять своей истинной природе, обстоятельствам, связанным со смертью друга, и скрытому насилию, отравляющему окружающий мир.

В будущем своё место среди достижений инновационных технологий займёт недоработанная система «Кидзуна» (яп. 絆 — «связь»). Смысл её в том, что если человек, в которого вживлён «Кидзуна»-чип, получает ранение, другие люди с такими же чипами оказываются ранены идентичным образом. В буквальном смысле связывая людей через раны, создатели системы хотят достичь мира во всём мире. Людей-обладателей чипа «Кидзуна» называют кизнайверами (или «связанными»). События аниме развиваются в вымышленном японском городе Сугомори-Сити. Город этот не простой, а возведённый на мелиорированных землях, и население его стремительно сокращается. Недавно переведённая в новую школу Норико Сонодзаки сообщает своему однокласснику, Кацухире Агате , что его планы на летние каникулы немного подкорректировали — он избран в качестве кизнайвера. С этих пор юноша будет связан с одноклассниками-кизнайверами. Но есть одна проблема: все они ведут непредсказуемый образ жизни, что в корне не устраивает нелюдимого Кацухиру.

Сериал поведает нам историю Минато Нарумии . Будучи ребёнком, Минато вместе с матерью побывал на соревнованиях по кюдо — японскому искусству стрельбы из лука. Он так вдохновился выступлением спортсменов, что решил тоже последовать по пути кюдо, и в средней школе активно тренировался. Однако, потерпев сокрушительное поражение в соревнованиях, он разочаровался в себе и решил бросить спорт. Всё меняется, когда он поступает в старшую школу. К тому времени Минато преодолевает кризис неуверенности в собственных силах и решает предпринять новую попытку. Так что он смело по новой вступает в клуб стрельбы из лука, где встречает своих старых соратников и противников, а также обретает новых друзей, рука об руку с которыми он будет стараться завоевать победу на окружных соревнованиях.

Репетиции, тренировочные лагеря, соревнования, фестивали, конкурсы. Каждый день был таким насыщенным, что Кумико Омаэ не заметила, как перешла на свой последний год обучения в старшей школе. Поколение, возглавляемое Юко Ёсикавой и Нацуки Накагавой, выпустилось, и теперь уже на плечи Кумико, ставшей новым президентом клуба, легла ответственность привести школьный оркестр старшей Китаудзи на национальный чемпионат. Для этого им нужно вновь получить золото на региональном соревновании, но в этот раз не «утешительное», а то самое, дарующее путёвку на встречу с ещё множеством потрясающих оркестров со всей страны. А вдобавок ко всему... весна ー пора новых встреч, и на третьем учебном году Кумико ожидает неожиданное знакомство.

Стихийные бедствия неизвестного происхождения, называемые «катастрофами», хаотичным образом возникают на землях Терры. Чтобы спастись, большинство людей переселилось в кочевые города — огромные передвижные платформы. Ориджиниум — вещество, выглядящее как чёрный полупрозрачный кристаллический минерал, возникает в местах, где произошла катастрофа. Ориджиниум содержит в себе огромное количество энергии, что поспособствовало быстрому техническому прогрессу, но также он стал причиной возникновения неизлечимой болезни орипатии. Тело заражённого постепенно кристаллизуется, а труп становится новым источником инфекции. Из-за этого в большинстве стран инфицированные подвергаются гонениям, сегрегации и принудительному труду. У «Родос Айленда», фармацевтической компании, оказывающей уход и лечение заражённым, есть цель — создать лекарство от орипатии и спасти всех от этой болезни.