Земля оказалась под водой: большая часть поверхности затоплена из-за катастрофического подъема уровня океана. Нацуки Икаруга, парень, потерявший мать и ногу в давней трагедии, владеет лишь старым кораблем, батискафом и долгами, унаследованными от бабушки-профессора. Чтобы расплатиться, он отправляется на поиски затопленного здания, где работала его бабушка, по слухам, хранящего драгоценности. Однако вместо них он находит капсулу со спящим роботом-гуманоидом. Проснувшись, робот по имени Атри обещает помогать Нацуки, пока не вспомнит последнее поручение своей прошлой хозяйки.
Теперь Нацуки предстоит выяснить, что за поручение получила Атри от своей прошлой хозяйки, и как это связано с его собственными поисками. На кону стоят не только огромные долги, но и возможное раскрытие тайн, оставленных бабушкой. Пока Атри пытается вспомнить свое прошлое, ее помощь может оказаться ключом к решению проблем Нацуки и пониманию загадок, связанных с его семьей и затонувшим миром.
